安徽医科大学临床医学院创建于2003年，是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院。2017年11月遵照教育部26号令要求由安徽医科大学与安徽新华集团投资有限公司合作举办。临床医学院自创办先后建立了基础医学部、临床医学系、卫生管理学系、护理学系、药学系、公共课程部、思想政治理论课研究教学部和生物医学系，现设有临床医学、药学、公共事业管理（卫生事业管理）、护理学、生物技术等五个本科专业。