长江航运总医院创建于1954年，是隶属于交通运输部长江航务管理局的事业单位，是一所管理科学、设施先进、专科齐全、以脑科为特色的综合性三级优秀医院，湖北省认定的第一所公立脑科医院，是武汉市医疗保险定点医院，湖北省、武汉市新型农村合作医疗转诊定点医院，承担着省内外10余所医学院校的教学任务，是北京天坛医院、德国柏林医院的技术协作单位。

医院地处江岸区惠济路，交通便利。开放病床800余张，设有57个临床科室，42个专业，14个医技科室，49个专家专科门诊，在岗职工千余人（含一个疾控中心），中、高级职称技术人员400余人，国务院政府津贴专家、武汉大学医学院兼职教授20余人。拥有320CT、MRI、DSA等适应三级甲等医院技术开展的一系列现代化医疗设备。神经内科、医学影像科、内科、外科和康复医学科是湖北省住院医师规范化培训基地。

医院长期坚持科技兴院、人才强院，精心打造了以神经外科、神经内科、康复医学科、骨外科、心内科、普外科等为重点的专业学科群。

武汉脑科医院是长江航运总医院与世界三大神经外科研究中心之一的北京天坛医院合作十年的结晶，设置病床300余张。其神经外科是中部医疗中心省级重点专科、武汉市重点专科，拥有一支优秀的团队，相继开展了涵盖颅内、椎管内所有部位的显微手术，部分技术已达到国内或国际领先水平。神经内科已开展“卒中单元”、脑动脉瘤介入治疗、脑血管病血管支架植入等技术。2011年6月，在国家发改委、德国联邦经济和技术合作部、德中卫生组织的见证下，医院开始与世界著名的康复医院-德国柏林医院开展全面技术交流和合作，康复医学科的疾病诊治技术水平和开放床位数已达到中南地区前列。